Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ap3b1Q9Z1T1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms