Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NfkbiaQ9Z1E3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms