Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cib1Q9Z0F4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cib1Q9Z0F4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cib1Q9Z0F4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cib1Q9Z0F4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cib1Q9Z0F4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms