Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVK8

Cyp46a1, Cholesterol 24-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp46a1Q9WVK8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp46a1Q9WVK8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms