Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clcn5Q9WVD4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clcn5Q9WVD4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Clcn5Q9WVD4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Clcn5Q9WVD4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clcn5Q9WVD4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Clcn5Q9WVD4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clcn5Q9WVD4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clcn5Q9WVD4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clcn5Q9WVD4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clcn5Q9WVD4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clcn5Q9WVD4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clcn5Q9WVD4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clcn5Q9WVD4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clcn5Q9WVD4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clcn5Q9WVD4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clcn5Q9WVD4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clcn5Q9WVD4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clcn5Q9WVD4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clcn5Q9WVD4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clcn5Q9WVD4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Clcn5Q9WVD4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clcn5Q9WVD4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clcn5Q9WVD4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clcn5Q9WVD4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clcn5Q9WVD4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Clcn5Q9WVD4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clcn5Q9WVD4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clcn5Q9WVD4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clcn5Q9WVD4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms