Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Srd5a3Q9WUP4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srd5a3Q9WUP4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms