Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nrf1Q9WU00 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms