Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nfe2l3Q9WTM4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms