Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TapbpQ9R233 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms