Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4eQ9R0Q8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4eQ9R0Q8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4eQ9R0Q8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4eQ9R0Q8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4eQ9R0Q8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4eQ9R0Q8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4eQ9R0Q8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4eQ9R0Q8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4eQ9R0Q8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4eQ9R0Q8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4eQ9R0Q8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4eQ9R0Q8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms