Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AmfrQ9R049 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AmfrQ9R049 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms