Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Ubxn8Q9QZ49 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms