Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms