Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Copg2Q9QXK3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copg2Q9QXK3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms