Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trp53inp1Q9QXE4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trp53inp1Q9QXE4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms