Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim44Q9QXA7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trim44Q9QXA7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trim44Q9QXA7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trim44Q9QXA7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trim44Q9QXA7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim44Q9QXA7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim44Q9QXA7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim44Q9QXA7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim44Q9QXA7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim44Q9QXA7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim44Q9QXA7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim44Q9QXA7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim44Q9QXA7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim44Q9QXA7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim44Q9QXA7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim44Q9QXA7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim44Q9QXA7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim44Q9QXA7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim44Q9QXA7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim44Q9QXA7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim44Q9QXA7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim44Q9QXA7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim44Q9QXA7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim44Q9QXA7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim44Q9QXA7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim44Q9QXA7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms