Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc5Q9QX29 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms