Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chaf1aQ9QWF0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms