Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dkk3Q9QUN9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms