Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psma6Q9QUM9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms