Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gkap1Q9JMB0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms