Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM83

Calm4, Calmodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm4Q9JM83 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms