Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Higd1aQ9JLR9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Higd1aQ9JLR9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Higd1aQ9JLR9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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