Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL0

Crim1, Cysteine-rich motor neuron 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crim1Q9JLL0 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crim1Q9JLL0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Crim1Q9JLL0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crim1Q9JLL0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crim1Q9JLL0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crim1Q9JLL0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crim1Q9JLL0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crim1Q9JLL0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crim1Q9JLL0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crim1Q9JLL0 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crim1Q9JLL0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crim1Q9JLL0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crim1Q9JLL0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crim1Q9JLL0 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Crim1Q9JLL0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Crim1Q9JLL0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crim1Q9JLL0 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Crim1Q9JLL0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Crim1Q9JLL0 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Crim1Q9JLL0 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crim1Q9JLL0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crim1Q9JLL0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crim1Q9JLL0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crim1Q9JLL0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crim1Q9JLL0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crim1Q9JLL0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crim1Q9JLL0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Crim1Q9JLL0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms