Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Tmod4Q9JLH8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Tmod4Q9JLH8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Tmod4Q9JLH8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmod4Q9JLH8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
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Tmod4Q9JLH8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Tmod4Q9JLH8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Tmod4Q9JLH8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Tmod4Q9JLH8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Tmod4Q9JLH8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Tmod4Q9JLH8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Tmod4Q9JLH8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Tmod4Q9JLH8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Tmod4Q9JLH8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms