Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot9Q9JKY0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnot9Q9JKY0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms