Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Irx5Q9JKQ4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irx5Q9JKQ4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms