Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms