Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms