Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trem3Q9JKE1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms