Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scamp5Q9JKD3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms