Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ap3m1Q9JKC8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms