Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ybx3Q9JKB3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ybx3Q9JKB3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms