Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Uchl3Q9JKB1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms