Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Msgn1Q9JK54 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Msgn1Q9JK54 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms