Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ctnnbip1Q9JJN6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms