Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmbr1Q9JIT0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmbr1Q9JIT0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms