Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc22Q9JIG7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms