Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pus3Q9JI38 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pus3Q9JI38 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms