Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RabggtaQ9JHK4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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RabggtaQ9JHK4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RabggtaQ9JHK4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms