Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tcirg1Q9JHF5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tcirg1Q9JHF5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms