Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHE4

Gal3st1, Galactosylceramide sulfotransferase, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gal3st1Q9JHE4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gal3st1Q9JHE4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gal3st1Q9JHE4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms