Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Cldn12Q9ET43 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn12Q9ET43 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms