Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Usp29Q9ES63 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp29Q9ES63 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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