Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SelenofQ9ERR7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms