Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrnb2Q9ERK7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrnb2Q9ERK7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms