Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlnrd1Q9ERE8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms