Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Clstn2Q9ER65 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Clstn2Q9ER65 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clstn2Q9ER65 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms