Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rapgef4Q9EQZ6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms