Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW4

Cyp3a44, Cytochrome P450, CYP3A, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a44Q9EQW4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp3a44Q9EQW4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cyp3a44Q9EQW4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp3a44Q9EQW4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp3a44Q9EQW4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp3a44Q9EQW4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp3a44Q9EQW4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp3a44Q9EQW4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp3a44Q9EQW4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp3a44Q9EQW4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp3a44Q9EQW4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp3a44Q9EQW4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp3a44Q9EQW4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp3a44Q9EQW4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp3a44Q9EQW4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp3a44Q9EQW4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp3a44Q9EQW4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp3a44Q9EQW4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp3a44Q9EQW4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp3a44Q9EQW4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cyp3a44Q9EQW4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cyp3a44Q9EQW4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cyp3a44Q9EQW4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cyp3a44Q9EQW4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cyp3a44Q9EQW4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms